La temporada de Mesut Özil en el Real Madrid ha ido de menos a más en la 2012/13. Durante el primer tercio del campeonato, José Mourinho exigía en cada partido mucho más al mediapunta. Este proceso, llevo a Özil a una etapa de estancamiento en su juego en el que no le salía nada en el terreno de juego. Su entrenador le pedía más participación en el juego del equipo y más compromiso en labores defensivas.
"Me has enseñado mucho en estos tres años", Özil a Mourinho
Con el paso de las jornadas, se empezó a ver el buen juego del alemán. En ese segundo tercio de la temporada continúo jugando en la posición de mediapunta aunque con el paso de las competiciones y la buena forma de Luka Modric, Özil jugó varios partidos en el extremo diestro del sistema ofensivo. Y es que la participación de Özil en el juego del Real Madrid es tan necesaria, que cuando falta se nota en demasía. Es el jugador que da la pausa en ataque y el que primer ve los desmarques de sus compañeros. Por ejemplo, Cristiano Ronaldo sabe de sobra que al realizar el desmarque en ruptura diagonal, su movimiento será recompensando.
Además, también ha sido una buena temporada como goleador para el 10 madridista, que ha hecho honor al número que lleva en la camiseta anotando nueve tantos en Liga BBVA y uno más en la Champions League. Así, en resumen, Özil ha disputado esta temporada un total de 50 partidos repartidos en 3.563 minutos entre Liga BBVA, Champions League y Copa del Rey. Sin duda, su mejor competición ha sido el campeonato liguero al lograr siete goles y repartir 12 asistencias de gol. Como dato estadístico, Mesut Özil cumplió 100 partidos oficiales como jugador del Real Madrid esta temporada.
| Competición | Partidos | Minutos jugados | Goles | Asistencias de gol | % de pases buenos |
| Liga BBVA | 32 | 2.123 | 9 | 12 | 79,02 |
| Champions League | 10 | 763 | 1 | 4 | 80,95 |
| Copa del Rey | 8 | 677 | 0 | 3 | 76,57 |
| Total | 50 | 3.563 | 10 | 19 | 78,84 |
*Hay que sumar una asistencia de gol de la Supercopa de España
Carta de despedida a Mourinho
Mesut Özil y José Mourinho llegaron al Real Madrid en la misma temporada, siendo el aleman una petición expresa del entrenador portugués y una de las mejores herencias que deja Mourinho al equipo blanco. Siempre fue uno de los jugadores más importantes para Mourinho y cada temporada ha dejado pinceladas de su calidad.
"Quiero agradecerle su confianza de corazón", Özil a Mourinho
A pesar de esos encontronazos a principio de temporada, Mesut Özil no quiso perder la ocasión de despedirse del que había sido su entrenador las últimas tres temporadas y publicó una carta dedicada al técnico portugués en una red social: "Querido José Mourinho, en el fútbol profesional te vas encontrando con gente y te vas separando de ella. Hace 3 años que me fichó el Real Madrid. En estos 3 años me ha enseñado mucho y ha confiado plenamente en mí. Por ello quiero agradecerle hoy de corazón, y desearle toda la suerte del mundo en su futuro como entrenador. Muchas gracias".